Le Navire de Recherche Al AMir Moulay Abdellah est dédié aux campagnes de prospection des petits pélagiques et aux campagnes océanographiques.

1. Campagnes de prospection des  petits pélagiques par acoustique sont basées sur les équipements  d'échosondage  et de chalutage  à  bord (Echosondeur SIMRAD EK60/ER60,Post processeur SIM RAD 81500 et Echoview, SIMRAD GPT EK60, 38KHz et 120KHz, Scanmar, ... ). Ces campagnes d'échosondage  sont réalisées suivant un parcours sous forme de radiales perpendiculaires  à la côte et qui couvrent  les eaux allant de la côte jusqu'à 500 m de profondeur.  Elles sont conduites durant  les saisons de printemps  et d'automne  le long de la Z.E.E marocaines, totalisant  en moyenne  plus que 12000 miles nautiques  parcourus, 450 coups de chaluts  opérés, 280 stations océanographiques  réalisées et 170 jours de mer.

Les  campagnes  de prospection   acoustiques  permettent   de pourvoir  les éléments   scientifiques  relatifs à  la biomasse, l'abondance,  la distribution   spatiale, la démographie  et la  biologie  des principales  espèces petits pélagiques,  notamment   la  sardine «Sardina pilchardus»,   le maquereau  «Scomber japonicus»l'anchois «Engraulis encrasicolis», les  chinchards «Trachurus trachurus»,«Trachurus trecae»,  «Trachurus mediterraneus»,  les sardinelles «Sardinella aurita» et «Sardinella maderensis». Ces campagnes permettent aussi le prélèvement et le suivi des principaux  paramètres du milieu marin et des œufs et larves de ces espèces.

2. Les campagnes de prospection  océanographiques  en mer pour la zone du large sont réalisées pour la collecte des paramètres  physiques du milieu (température,  salinité, profondeur  et densité) à l'aide de la sonde CTD (Conductivity/Temperature/ Depth)  de la surface jusqu'au  fond  de la  colonne  d'eau. D'autres échantillons  d'eau de mer sont collectés  par bouteilles d'eau de mer à différents  niveaux de la colonne  d'eau pour  analyses ultérieures  aux laboratoires centraux de l'oxygène dissous, des sels nutritifs,  de la chlorophylle  «  a »  et du phytoplancton. Des échantillons  biologiques   sont aussi collectés  à différents  niveaux de la colonne  d'eau par filet  Bongo, pour  analyses ultérieures  aux laboratoires  du zooplancton,   oeufs et larves du  poisson.